原則上葉綠體Elisa試劑盒可用于檢測一切抗原、抗體及半抗原，可以直接定量測定體液中的可溶性抗原。在實際應用方面可用于疾病的臨床診斷、疾病監察、疾病普查、法醫檢查、獸醫及農業上的植物病害的診斷檢定等。因此，它和生物化學、免疫學、微生物學、藥理學、流行病學及傳染病學等方面密切相關。按照待測物性質的不同，ELISA反應可以分為抗原檢測反應及抗體檢測反應。

       而用ELISA檢測抗體，已獲得對多種傳染病和寄生蟲病的血清學診斷，亦開始廣泛用于現場流行病學調查。還可用于破傷風抗毒素和霍亂弧菌抗毒素的測定以及檢測斑疹傷寒立克次氏體感染后的抗體作診斷，也可用于對立克次氏體的種屬鑒別，還有用于檢測鸚鵡熱衣原體抗體的報導。ELISA也可應用于病毒抗體檢測、鑒定病毒型別。在免疫性疾病方面有試用作自身疫病抗體測定以及對過敏的診斷，例如檢測各種過敏原的抗體、DNA抗體及甲狀腺球蛋白抗體，紅斑性痕瘡抗體等等。在衛生學方面，可用于檢測食品中葡萄球菌腸毒素及沙門氏菌毒素等等。

    在實際應用中，通過不同的設計，具體的方法步驟可有多種。由于抗原、抗體的反應在一種固相載體-聚苯乙烯微量滴定板的孔中進行，每加入一種試劑孵育后，可通過洗滌除去多余的游離反應物，從而保證試驗結果的特異性與穩定性。